Bien que situées dans une région volcanique, les Grottes de Jonas ne sont pas naturelles, mais ont été creusées dans le tuf par les hommes qui y ont aménagé l’ensemble des constructions typiques d'un petit village médiéval. Le creusement de cette falaise, bien abritée du vent et du froid évitait d'acheminer des matériaux de construction.

Ainsi, les premières grottes sont aménagées au X^ème siècle par des moines, puis, au XIII^ème siècle, les falaises accueillent un chevalier et les familles paysannes qui dépendent de lui : c'est un fief.

Afin d’organiser au mieux la vie du village, le chevalier y fait construire un manoir avec ses dépendances, des greniers, destinés à recevoir les parts de récolte dues par les serfs, et une chapelle, témoin de l'importance de la religion chrétienne.

A l’époque, toute la vie des habitants dépendait du chevalier et le passage obligé par des lieux comme le pressoir, la boulangerie, le moulin et même les ponts étaient soumis à des droits d’usage dus au maître des lieux en échange de sa protection.

Véritable village, comptant plus de soixante-dix pièces réparties sur cinq étages reliées entre elles par de nombreux couloirs et des escaliers en colimaçon, Jonas connut son apogée au Moyen-âge en accueillant pas moins de 600 personnes.

Après avoir servi de refuge pendant la guerre de Cent Ans, cet habitat troglodytique est peu à peu délaissé et à partir du XVIII^ème siècle le site ne sera plus habité.

Cependant les vestiges qu’il recèle encore nous renseignent sur la vie des hommes dans cette région pendant plus de cinq cents ans.